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最開始的榮耀研究所是完全的研究機構，研究的就是改造強化以及戰術醫療等等涉及到指揮官艦娘方方面面的一個機構，也正是因為這是完全的研究機構使得這個機構實力相當的強大，不過當時的整體實力也不是很強，占領的島嶼也不是很多，當時的榮耀研究所就在目前鐵血勢力總部，這里是建造出大量歷史戰艦的地方，三大勢力的sss級歷史戰艦中除了維內托其他所有包括已經被擊沉的沙恩霍斯特格奈森瑙兩姐妹都是在這里被建造出來的，鐵血勢力總部也是到目前為止防御最優秀的島嶼沒有之一，造船廠也要比公正榮耀兩大勢力的造船廠優秀得多。

一開始榮耀研究所是相當團結的，根本沒有什么對立之類的事情發生，當然那個時候主要是因為相當的危險，鐵血勢力總部之所以防御那么優秀一個很重要的原因就是當時的情況相當的不理想鐵血勢力總部是作為最後的堡壘打造的島嶼防御系統。

不過後來隨著勝利不斷的到來榮耀研究所漸漸發生了分裂，因為很多時候研究是有分歧的，在外部壓力很大的情況下這種分歧是可控的，但是當外部壓力沒有那么大的情況下內部的矛盾就會爆發，首先就是主導島嶼防御系統的指揮官們與其他研究的指揮官起了巨大的矛盾。

島嶼防御系統的研究以及建造需要耗費海量的資源，隨著研究以及建設的加大島嶼防御系統的開支越來越大，這就讓其他項目的指揮官產生了極大的不滿要求削減島嶼防御系統的開支，這勢必引起了主導島嶼防御系統指揮官們的不滿，但是因為探究島嶼防御系統的指揮官們數量不是很多所以最後還是通過了限制條例，這是榮耀研究所第一次巨大的矛盾，因為限制條例過於苛刻這埋下了後來出現的三大勢力的禍根。

因為島嶼防御系統很是復雜所以從單純的研究方向來看研究島嶼防御系統的指揮官數量是最龐大的，但是可以通過限制條例是因為其他的指揮官聯合了起來，這使得研究島嶼防御系統的指揮官們覺得有必要團結在一起，這些團結起來的指揮官就是後來公正勢力的雛形，也是為什么公正勢力的島嶼防御系統做的最好的核心原因，因為最開始的公正勢力指揮官就是研究島嶼防御系統的。

團結起來的這些島嶼防御系統指揮官開始利用資源研究其他的項目，這就出現了分化，因為這些指揮官不是全職研究是要參加戰斗的，研究需要經費所以這些指揮官顯得越來越不合群與其他指揮官矛盾也越來越大，而這個時候其他的指揮官也不是鐵板一塊了。