從11月25日開始直到月底，東岸人運送各種物資、人員的行動一直持續了整整七天。而在這期間，青州和託部清軍的動向一直很令人詫異，他們顯然是知道了李率泰大敗而回的消息，但不知道怎么想的，他們始終沒有集結大軍來攻打安丘的「黃衣賊」。也許是他們戰兵的數量稀少（五千出頭），也許是他們的糧草不足，當然更可能是東岸人展現出的戰力讓他們有所忌憚，總之他們沒有再派人來對東岸人采取行動。

11月28日一大早，清軍膠州總兵柯永盛、登萊巡撫陳錦率四千余兵馬趕到青州，與和託、李率泰等人會師。至此，清軍共集兵兩萬余，其中戰兵過七千。當日，和託將自己本部兩千余滿洲戰兵分出來用於防范黃衣賊，然後督促李率泰、柯永盛二人兵猛攻青州城。

而已經得到東岸人安丘之戰大獲全勝消息的趙應元等人，也堅定了死守青州的決心。他們采取了老套路，即把城內富商、縉紳的銀兩、布帛甚至女人通通搶了過來，然後分給麾下士卒，激勵他們奮勇作戰。有些當家的看到東岸人送過來的張汝行人頭，胸中頓時也生出了些許豪氣，紛紛走上城頭帶領孩兒們與那些投降滿清、數典忘祖的漢軍綠營作戰。

清軍猛攻一整天，遺屍千余具，不克。11月29日，在看到無法快攻克青州城後，天寒地凍外加糧食略盡。和託不得不下令城外清軍分批撤退，返回濟南，同時派人火前往北京請求援兵，並特別要求增撥十余門能攻城的紅衣大炮過來。

至此，一度聲勢浩大的青州戰役就這樣草草告一段落。歷史上和託等人率領的大軍通過埋伏在青州城內的張文衡的協助，假意招降趙應元等人，然後在會盟地點將趙應元等數十名領通通斬殺，最後還收編了其數萬部眾。而現在事情弄成了這樣，不但沒能輕易拿下青州城，甚至還損兵折將七八千人。這一進一出的差距不可以道里計。而且。歷史上拿下青州城後，清廷委任的登萊巡撫陳錦還挾此威勢招降了據守登州城的明副總兵楊威，然後順利克復整個登州府。但是如今一切都不一樣了，青州不說。這登萊二府翹盼望我大清「王師」到來的士紳地主們恐怕要大失所望了。登州這種名城自然也不會再輕易投降。再加上濟南、東昌、兗州諸府此起彼伏的反清義軍。山東局勢再次陷入了混沌之中。

11月3o日，先期離開的四艘海軍運輸船再次抵達了膠州灣。而已經輸送完手頭物資的東岸大軍在得知清軍撤離後，也離開了已經屯駐了十來天的安丘縣。向南快行軍，並於12月2日下午抵達諸城縣。清廷委任的縣令棄城而逃，東岸人不一槍一彈進駐了縣城。在照例釋放囚犯、征集糧草、招募志願墾荒人員後，東岸人於第三天離開了諸城縣，而離開之前還公開處死了十余名五月叛亂時驅逐、擒殺大順官吏的士紳，並將他們存於城內的家產予以沒收。

離開諸城縣後，東岸人再次冒著中雪於12月8日抵達了日照縣。日照縣的士紳當初作孽太多，所以對東岸人的抵抗較為頑強，以至於東岸人花費了大半天的時間才依靠大炮攻進了城內，為此還死傷了近3o名挺身隊的士卒。因此，入城後的東岸人將這些抵抗士紳本人及其男性繼承人全部處死，家產予以沒收，妻妾女兒編入了女子挺身隊。

照例在日照縣停留了一日後，東岸人於12月1o日再度出，開始掃盪日照附近的安東衛城及各下轄衛所，最遠甚至向西活動到了贛榆、沂州一帶，讓清廷設立的沂州總鎮極為緊張，連連向濟南和北京告急，言「黃衣賊莫茗，擁二十八萬眾犯沂州，臣決死迎戰，三進三出、被創數十始擊退賊軍。然賊兵銃炮犀利，裹挾流民，縱橫州縣，勢甚猖獗，伏乞朝廷真滿洲官兵一萬，以誅此獠。」

掃盪完夏河寨前所、靈山衛這最後兩個據點後，東岸人帶著近兩千名志願跟隨東岸人拓荒的明人百姓、五千多石糧食、四百多名俘虜（含五十余名女子挺身隊）、大量牲畜輜重再次回到了膠州灣，而此時已經是12月18日了，煙台港差不多已經封凍。沒辦法，只能讓六艘海軍船只將這些人員物資通通轉運到利尻島鴛泊港過冬基地上去，至於這些東岸6軍、挺身隊、軍夫隊，他們只能靠兩只腳走回煙台了。好在如今登萊青三府成點氣候的清軍基本都被擊垮了，其余也都退回了濟南，東岸人這一路上大搖大擺地走回去相信沒有任何人敢於攔截。