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黨中央、國務院對此事非常重視，數度組織專家進行研究、解釋、辟謠，中國工程院院士周福霖在央視的直播節目里說道：
「地震前的動物異常反應是科學的，敏感的動物會察覺到地震變化。然而，動物除了對地震會有敏感反應外，亦會對其他自然現象產生敏感反應，因此，蟾蜍遷徙只能作為可能發生地震的參考，並不能作為震前的可靠預測，四川綿竹市、吉林長春市等地的蟾蜍遷徙的現象，屬於正常遷徙。」
動物專家侯鏡如也舉例說道：「這種蟾蜍的大規模遷徙現象，也曾出現在出現在二00五年七月的吉林長春、二00六年四月的重慶、出現在二00六年五月的江蘇泰州、出現在二00七年四月的四川成都、出現在二00七年五月的河北唐山、出現在二00七年九月的山東臨沂、……各地區多次分別進行了報道，但其後並未發生地震。」
著名科學家賈立波也出面解釋：「至於都江堰老鼠、黃鼠狼、蜻蜒、燕子等遷棲，可能是與當地環境發生某些變化，導致植被與食物鏈發生短缺，引起生存環境的惡化，從而使得大批量動物們集體遷棲，百姓們不必大驚小怪，也不必過份擔憂和恐慌。不過，由此帶來的環境惡化、生態平衡的破壞值得主管部門警惕與思考，進而找出改善環境、恢復植被、解決生態的應對辦法和拯救之出路……」
話雖如此，但種種跡像還是讓專家們放心不下，感到某種不祥的擔憂，盡管專家們在電視里、在台面上，振振有詞，侃侃而談，可私底下在心里也不無疑慮，不無憂心啊，蟾蜍呀蜻蜒呀老鼠呀等動物遷棲，可以拿環境、生態說事，可邛崍的水塘突然干沽之事，又拿什么理由來解釋呢？
縱然科學家普遍認同地震難以預測，但自然界的動物們對大的自然災害還是有提前預警的，時常還會伴有災害前的怪風、淫雨、黃塵、大氣混濁等各種現象發生。
根據以往經驗總結，一般在地震前的一年或幾年的一定時段內，先出現大旱而後是洪水大澇，或先是大澇而後大旱，或旱澇交替出現，之後便發生大地震，這種震例國內外均有。
比如一九七0年南通地震，在前二、三年都出現過百年不遇的特大洪水，造成大澇，之後就出現少有的大旱，又比如一九七六年的唐山大地震、一九**年的河北大名地震，震前都出現過旱澇交替的現象。
也許，種種跡像表明，四川境內某處莫非真的要發生大的災害？……
專家們展轉反側，食不甘味，夜不能寐，憂心忡忡，心里祈禱但願不要發生大災大難，老天保佑我國人民平安，但為了保證奧運前的安定局面，科學家們從不敢表露心里擔憂的任何信息，每天都戰戰驚驚地工作著，茫然無知地擔憂著，忐忑不安地等待著，行屍走肉地捱日子，疑神疑鬼地賴活著。
可是，沒過多久，專家們擔驚受怕的事情更是一茬接—茬地到來，也就在專家們一籌莫展的時候，距汶川六、七十公里，海拔一千二百六十米的都江堰青城山上的一台測雨雷達，以及附近一台空軍警戒雷達，三月二十六日、二十七日，連續收到來自藏、川、青海上空一種奇異扇形指狀回波。
這種回波與海浪干擾、晴空湍流等引起的回波不一樣，使監測人員十分惶惑，更惶惑的是藏、川、青海的人們，就在這個強大的磁場中毫無知覺的穿行，有理由說明上述地區磁場發生了某些變化，變得不可預測。
無獨有偶，三月二十七日，成都北部新都區大灣村的一個軍營里，幾個士兵驚叫起來，他們發現混凝土地板突然像照x光一樣，顯現地下有一堆鋼筋，莫名其妙地迸發出閃亮的光，仿佛一個隱身人在那里燒電焊，人們被那股燒電焊的異味熏糊塗了。
還有奇怪的，在營區外的河谷地帶樹林間，莫明其妙地飄來一股淡黃色的霧，它障人眼目，令人迷惑，散步的士兵們往往眨著迷惑的眼睛，找不到回家的路，有的戰士還迷迷蒙蒙、不知不覺地走到深夜才歸營。
而在部隊營區里，不少營中已關閉的日光燈，在半夜里突然奇怪地亮著，還忽閃忽閃的。
空軍部隊對警戒雷達發現的奇異扇形指狀回波事件及軍營中發生的奇異事件非常重視，當即報告到了成都軍區，軍區又上報到了軍委，軍委又找到了中國國防科技工業局，該局調動了九種型號十五顆衛星為該地提供支援。
參與偵測的衛星包括「風雲」系列氣象衛星、「資源」系列對地觀測衛星、「北斗」導航衛星，「遙感」系列衛星、「北京一號」小衛星，還緊急啟動中國實踐九號a星、資源三號、資源一號02c星、環境一號a/b星等五顆衛星，拍攝包括樂山、峨眉、雅安、邛崍、崇州、都江堰、汶川、茂縣、綿竹、北川、棉陽、江油、廣元、青川等一大片地區。
利用遙感數據成像技術，結果發現在近一段時間，四川西南、西部，中部、中北部上空，電離層比正常值明顯下降了一半，而且比對過去資料，發現比正常值明顯下降至少超過七成，這就為地震的即將發生，提供了科學依據，據科學資料分析，規模在五級以上的地震在發生前，震中央上空的電離層，都曾經發生過突然變稀薄的情形。
另據資源衛星從近地軌道傳回的資料，從外太空觀測地球時，竟然發現了地球周邊電離層也有了顯著的變化，極可能是地震的發生先兆，從太空上看，地球上空五十公里到數千公里間，有天然生成的游離電子、離子電子聚集籠罩，被稱為電離層，研究發現，盆地西部、中部、北部上空的電離層密度突然變得稀薄起來，密度比平時少了整整百分之五十。
專家們把探測到的資料做成圖表，輔以顏色，顏色越紅表示電離層越濃，顏色越藍表示電離層越稀薄，從東往西可以看到，打圈圈的四川地區，最東邊地區電離層濃度正常，顏色紅紅的，中西、中北部地區顏色明顯變藍，而且成都以西及西北地區逐漸變成深藍色，這顯示電離層密度連續多天在一路下滑。
還有，氣象衛星也探測到四川多地最近氣溫異常，今年一、二月份以來，省外還處冰凍寒流雪災搶險，可四川盆地氣溫比歷年同期高出3.7度，平均氣溫由零上一至三度一下增到零上十七、八度。
尤其春節那天，當天八時至九時半的這段時間里，暴發性增溫十二度，使乍暖還寒的季節里出現了悶熱的現象。
這些情況於最初發現時，沒有人做過多猜想，也沒引起專家們的研究與重視，考慮到年前年後冰雹、凍雨、雪災對我國的影響，大家都認為出現一些氣候和天氣的異常現象也算情理之中。
不曾想，因這次電離層變化的發現，引發了專家們對氣候的關注與聯想：暴發性增溫在地震學來說就叫熱異常，在某些地震之前非常明顯，這種異常現象，是由於孕震區處於地殼激烈變動前夕，臨破裂前地下熱能發生了劇烈擴散，並通過某種途徑輸送給了大氣。
不過，這種熱異常范圍小，持續時間短，一般情況下很難識別。
接下來的幾天里，《美國國家地理》一項科學報告，也指出並警告中國地區將面臨一次大型地震。科學家們在十個月前就通過仔細研究衛星圖像，對四川省的地殼斷層的十年來的深度和活動進行深入研究，有充分證據證明中國地區即將面臨一次大型地震，從而發出了以上警告。