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到1899年，世界主要強國陸軍兵力的人數還是俄國最多，高達116萬人，當時法國陸軍只有71萬人，英國只有62萬人。雖然人數並不決定戰斗成敗，而且中國的新軍武器也比較先進，還有近百輛原始坦克，但要徹底征服俄國一百多萬陸軍，不是那多容易，李經述決定一邊跟俄國的革命者聯系，搞亂俄國，一邊

先進行國內的訓政改革，等待合適的時機。

在李經述的第一個任期內，梁啟超、嚴復等人都覺得松散的聯邦制將使國家軟弱可欺，支持中央集中權力，各省的民政長也都由北洋將領兼任，除了張之洞、劉坤一、王韶文控制的七個省外，所有內地省份都被李經述控制了。作為一個具有現代思想的人，李經述推崇嚴格的管理手段和行政法規，強調官場紀律，規整政府機構，任用自己認為可靠的人，並且把國內的穩定放在首位，不顧一切要消除不可預料的事情的強烈*，有時候讓人望而生畏，這很容易讓人誤以為李經述熱衷於貪求不受道義制約的個人權利，成為中國實質上的「皇帝」。

各省越來越多的人也對北洋將領的軍政獨裁造成的*表示不滿，李經述懲一儆百。先是革掉張勛的雲南省都督一職，將他手下的三十個營裁撤到三個營，調往徐州駐防，開始由軍政階段往訓政階段轉變。

李經述野心勃勃。堅持通過復興會建立一個強有力的中央政府，控制軍隊和報紙輿論，他認為這最適合中國的國情。而貨幣改革的順利進行、戰敗日本和西班牙，也正說明了這一點。

等到1899年過完春節，李經述邁出了全國訓政的第一步，頒布了總統一號令，在削弱各省都督權力的基礎上，加強各省的民政長官的權力，宣布由各省的民政長官主管省內稅收和縣知事的任免，各省都督不再參與民政事務。李經述還讓吏部選拔稱職的文職官員，特別是對縣知事一級的人選，考試的內容不再是四書五經，而是行政法規和一般的知識，十萬人在北京參加考試。

通過一系列強有力的改革，在這場整肅官場的運動中，中央的權威大大加強，地方對中央政府的指示也落實得很快，國會很快通過了新的《刑法》、《民商法》、《行政法》。此時，中國義務教育普及到小學階段，農村很多地方都開了夜校，文盲越來越少，加之中國人本來就有「萬般皆下品惟有讀書高」的傳統觀念，全國高等的學堂發展到一千多少所，城市里的青年學生達到五十多萬人，成為不可忽視的一個階級。

李經述通過復興會的《中央日報》、《華報》、《申報》等報紙向全國闡述了什么是真正的自由、平等：今天婦孺嘴上都知談平等一詞，而平等只是在法律面前人人平等，並不意味著行政等級之分應予取消或者每個人都是一樣的，並不意味著個人皆可否定法律，自立准繩，或者在經濟上人人均等。自由是另一華麗的現代詞，但它是限制在法律范圍之內的，在此范圍之內人是自由的。不受限制的自由，這個東西是不存在的。法律的最高目標，是保障自由，正所謂法無明令則政府不禁止。共和也是一個雅致的詞，但洋人對這個術語的理解，是在國內有普遍的發言權，而不是全民都必須干涉政府的行動。這種干涉除了造成混亂之外，還可能造成什么結果呢？至於民權這個術語，除了選舉總統的最高特權外，它還包括代議權、選舉權、監督權，但切不可理解為民眾直接處理行政。

第二共和國的政治體制是在中央政府直轄之下、實行以行政長官為核心的行政主導、行政與立法既相互制衡又互相配合、司法獨立的政治體制。這一表述也可以簡明扼要地概括為以行政長官為核心的行政主導體制。政治體制既沒有照搬西方的政治體制，也沒有照抄其他亞洲國家和地區的政治體制。

總統在整個政治體制中處於核心位置，這是第二共和國行政主導體制最大的特征。根據憲法的規定，總統具有雙重身份，既是國家的首長，也是軍隊的首長，同時對中央人民政府負責。總統具有超然於行政、立法和司法三個機關之上的特殊法律地位，處於特區權力運行的核心位置。

而且行政管理權相對於立法權處於主導地位，內閣政府的行政管理權涉及社會政治、經濟、文化、民生等方方面面，關系到國民的衣食住行，相對於立法權涵蓋面更大，影響更直接，作為更主動。不過講行政主導並不意味著行政管理權獨大，不是說立法會要放棄對行政機關的監察責任，更不會妨礙立法權和司法權的正常行使。

新的政治體制又吸納了西方政治體制中行之有效的成分，特別是司法獨立、文官制度、咨詢架構等。符合中國的實際情況，有利於政府決策和施政的高效能，也有利於兼顧社會各階層的利益、保持繁榮穩定。

此時的第二共和國，經濟和國防工業迅猛發展，政權日益穩固，已經成為亞洲第一大帝國，疆土橫跨今天的中國大陸、台灣、琉球、蒙古國，還有越南、朝鮮、菲律賓、關島等殖民地，因災荒移民到這些殖民地去的數百萬華人，成為當地的特權階級。中國的艦隊，成為亞洲名副其實的第一強艦隊，排名世界第四，僅次於英國和德國、法國。

到1899年底，中國也並非就是太平盛世了，首先是俄國侵占中國的一百五十萬平方公里的國土還未收回，尼古拉二世還覬覦東北地區，此時的香港此時還未回歸，1842年8月29日清政府與英國簽訂不平等的《南京條約》，割讓香港島給英國，1860年10月24日：中英簽訂不平等的《北京條約》。割讓九龍半島界限街以南地區給英國，香港處於英國的殖民統治之下，澳門還在葡萄牙人手里，各國在中國的租界仍然存在。但比這些問題更可怕的是：執政的復興會派系漸生。比如李鴻章原來的老部下在改革中利益受損，他們以李經方為首，形成了一股強大的勢力「李黨」；以容閎為首的留洋勢力，追求美國式的民主和共和，構成「洋黨」；以中央組織部長席家銘為首大財團、商人組成「席黨」，以徐世昌、袁世凱為首的北洋軍官組成的「北洋黨」。礙於復興會主席李經述的巨大權威，他們的矛盾才沒激化，表面上才相安無事，但暗地里各種權力的爭斗，讓李經述很惱火，他努力平衡著各方的勢力。