關莫雨有信心是因為有另一個世界的成績在哪里頂著，而張雅的信心則完全來自於關莫雨。

占據東京都的三分之一（將東京西部占據，並占有埼玉縣和神奈川縣一部分的圓形城市），居住著230萬名人口，其中八成人口是學生的巨大都市。

分為23個學區，和外部隔離，擁有領先世界20－－30年以上的最尖端科技，所有學生都接受超能力開發，全世界都有合作組織。

這就是學園都市，也是《魔法禁.書目錄》故事進行的地方。

所謂超能力，是學園都市所研究出來的超能力，是量子力學理論的重大突破。

通過「只屬於自己的現實」，也就是透過刻意扭曲的演算機能與判斷能力來觀測的現實，讓極端的微觀世界機率出現不自然的變化，借以創造出某些現象。

表面上是「記憶術」或「背誦術」，實際上則是對靜脈施打葯物（投葯）、在皮膚貼上電極通電（物理刺激），或是以耳機輸入節奏（催眠暗示），以這種方式進行人為的超能力開發。

因為多重能力對頭腦的負擔太大，所以學生只能使用一種能力，不可能同時具備兩種以上能力。

也已開發出來的能力也是不可能變更的，就算移植大腦也不可能。

學園都市的能力開發課程最年少是從五歲開始。

能力名稱分成學校決定的簡單名稱，例如「念動力」或「發電能力」；以及學生自己決定的「超電磁炮」等。

以學生為對象開發出來的「能力」因人而異，劃分為各種種類，但根據其價值、強弱及應用性等基准，根據能力高低不同，可以分為6級，由低到高分別為：

level0無能力者，無法測量或效果極其微弱的能力，占全部學生60%。

level1低能力者，能勉強弄彎湯匙的程度，對日常生活基本沒有幫助。

level2異能力者，稍微比level1有用的程度。

level3強能力者，日常生活中能得到活用、帶來方便的程度。

level4大能力者，在軍隊中體現戰術價值的程度。

level5超能力者，能單獨對抗一個軍隊的程度，整個學園都市也就僅7人，但不乏其他有可能成為lv.5的人。

當然，在理論上還有第七個等級，也就是level6絕對能力者，「以非神之軀，抵達神之領域者」，尚無人達到，可以說是一個幻想中的等級。

而大多數學生都被劃分在等級0到2之間，能力以威力和綜合干擾系數評級，並每隔一定時間會重新測定一次。

他們每天都在超能力開發上進行相互競爭。

故事的主角上條當麻是學園里的一個無能力者，但並非完全沒有能力，他的能力是能夠將一切異能之力無效化。

他只有右手能夠使用這種能力，還給自己的這種連上帝的奇跡都能抹殺的能力取名為「幻想殺手」。

而正因為他的右手似乎把神的祝福都給抹殺掉的緣故，導致自己一直過著不幸的生活。

某一個暑假的日子，在家里的陽台上，他遇見了一位修女；這位少女自稱自己的名字叫「茵蒂克絲」，並是從魔法的世界逃了出來，現在正在被魔法師追趕中。

就這樣，掌握了十萬三千本究極魔法書的少女與擁有抹殺一切奇跡的神上之手的少年，將面臨一系列故事...。