對於海漢執委會和國防部來說，當然巴不得像特戰營這樣的精銳部隊越多越好，畢竟武力才是海漢國不斷開疆拓土的真正有效手段。但這中間又有一個所有人都不得不正視的悖論，那就是精銳部隊必然都是由高級將領們親自組建並長期操訓，這樣兵員的素質和部隊的戰斗力才能得到最大程度的保障。可如此一來，這些部隊往往長期聽命於將領一人，直接效忠的對象並非遠在三亞的執委會，很容易演變成事實上的軍閥，甚至會割據一方自成派系。原本是為了鞏固統治的目的才花費重金去組建和維持這些精銳部隊，但當這些部隊的實力壯大到一定的階段，執委會的統治反倒會因此而存在更多的隱患。

要預防某些極端狀況的出現，除了加強軍隊的政工工作之外，還有一個極為重要的手段就是定期更換這些部隊的駐扎地。雖然這種措施需要額外消耗大量的軍費，以及安排極為復雜的部隊跨地區調動的行動計劃，但所能取得的效果倒是毋庸置疑。

像特戰營的駐地，幾乎是每過一兩年就會進行更換，而且往往是去到海漢地圖的邊陲地帶執行作戰任務。特戰營在地方上基本沒有根基可言，其後勤供應和新兵招募都十分依賴於國防部的支持，也就沒了演變為軍閥勢力的大部分客觀條件。

海軍所屬的陸戰隊也是類似的情況，由王湯姆親自打造的這支兩棲部隊在海南島之外並無固定的駐扎地，基本就是看哪里有作戰任務就隨海軍往哪里去，在需要通過海路進行遠程投送的任務中比陸軍多了一分效率。特別是在兩棲作戰的環境下，這支部隊的戰斗力甚至毫不遜色於號稱海漢第一軍的特戰營。

騎兵營的狀況則有些特殊，在駐地必須要為戰馬修建馬場，否則數百匹戰馬的長期安頓會是一個極為麻煩的問題。所以騎兵營的每一處駐地都得花費大量經費在馬場上，為了能夠盡量節約軍費，駐地會相對比較固定，而且在海漢國的統治區內，除海南島上的戰馬牧場之外，也就那么有限的幾處而已。對騎兵營的調動，大致都是圍繞著這幾處有馬場的地方來進行安排。

目前駐地比較固定的精銳部隊，也就只有羅傑的南海特戰大隊了，這支部隊早在他主政安不納島期間就已經開始組建成型。自海漢在1633年底進駐星島之後，羅傑就一直在當地擔任軍事主官，並於1634年開始打造自己的班底。他手下這支部隊在來馬尼拉之前，主要的活動范圍也是集中在馬六甲海峽，實戰經驗比起另外幾支隊伍都要少得多，可以說是精銳部隊中的小鮮肉了。

鑒於這支部隊及星島地區的現狀，國防部暫時不會將其調動到其他地方駐扎，所以馬尼拉戰事終結之後，羅傑依然會率領這支部隊回到原來的駐地，繼續為海漢守護住南海的西邊門戶。

而這幾支精銳部隊離開馬尼拉之後，將留在本地接管治安防務的是從海口調過來的陸軍營。營長於鐵柱從1627年開始就一直在軍中服役，也算是海漢的開國功臣之一，他所指揮的這個營在早年還一度擔任過勝利堡的衛戍部隊，戰斗力雖然尚不及那幾支精銳部隊，但在陸軍中也已經算是第一等的存在了。

在馬尼拉戰役中，於鐵柱和他的部隊幾乎全是在干苦活累活，給另外幾支精銳部隊充當候補和負責輜重運輸，並沒有得到什么出風頭的機會。不過這本來也是情理之中的事，國防部好不容易才從天南海北將麾下的精銳部隊全部集中到馬尼拉，目的就是要畢其功於一役而不能出現任何意外，自然是要將這幾支王牌軍全部堆在戰場第一線。而以普通部隊參戰的這個陸軍營，自然就只能受點委屈當當綠葉了。

不過於鐵柱對這樣的安排倒是不會介意，因為出發之前國防部長顏楚傑便與他有過一次面談，問過他是否願意率領部隊到海外駐扎。於鐵柱很清楚如果想要軍功，駐外肯定比待在海南島的機會更多，雖說馬尼拉是一個相對比較陌生的地方，但也不是什么不毛之地，到當地之後不用擔心基本的生活設施和物資補給問題，軍餉也要比待在海南島高出一截，說不定還有機會跟周邊的土著武裝打上幾場積累軍功，那又何樂而不為呢。

邱元和蕭良抵達馬尼拉之後，便立刻開始接手本地的軍政事務。相對而言，軍方的防務和指揮權轉交工作還比較簡單，因為此時顏楚傑等將領都還尚未離開馬尼拉，蕭良可以通過他們獲得更為詳細的本地信息，不至於會在接手後毫無頭緒。而於鐵柱在海口城駐扎期間，邱元正好便是他的頂頭上司，軍政雙方的很多工作就更容易溝通了。

當然執委會和國防部作出這樣的人事安排，未嘗不是考慮到了這樣更便於快速接手馬尼拉的軍政事務，而且蕭良在廣東期間也算是帶過兵，不至於因為業務不夠熟悉會被下面的人給架空。

關於防務的交接，其實臨管會在此之前就已經有了安排，不過因為海漢軍在巴石河以北地區的清剿行動仍在進行之中，所以相關的交接工作就繼續順延，蕭良也因此得以有更多時間來熟悉本地的狀況。

海漢軍在巴石河北岸的行動也並不是一帆風順，逃往這一區域的西班牙人往往都是非富即貴，不少人都擁有小規模私人武裝，對於海漢軍的追擊，他們理解為這是要趕盡殺絕的意圖，自然不會輕易放下武器就范。而海漢軍所得到的指令，便是對所有的抵抗行為實施打擊，這樣一來不可避免地就發生了多起武裝沖突，雙方也都各有死傷。