一位參與屠殺的羅剎兵記述了整個大屠殺的過程：「到達布拉戈維申斯克（海蘭泡）時，東方天空一片赤紅，照得黑菱江水宛若血流。手持刺刀的羅剎軍將人群團團圍住，把河岸那邊空開，不斷地壓縮包圍圈。軍官們手揮戰刀，瘋狂喊叫『不聽命令者，立即槍斃。』人群開始象雪崩一樣，被壓落入黑菱江的濁流中去。人群中發狂一樣喊叫聲震藍天，有的想拼命撥開人流鑽出羅網；有的踐踏著被擠倒的婦女和嬰兒企圖逃走。這些人或者被騎兵的馬蹄蹶到半空，或者被騎兵的刺刀捅翻在地。隨即羅剎國兵一齊開槍射擊，喊聲、哭聲、槍聲、怒罵聲混成一片，凄慘之情無法形容，簡直是一幅地獄的景象。」

「清掃現場的工作，緊跟在一場血腥的屠殺之後立即開始進行。那堆積如山的『屍體』，大部分是氣息未絕的活人，他們周身肝腦迸濺血肉狼藉，場面慘不忍睹。不管是死是活，那些華蘭人都被羅剎軍一古腦兒地投入江水。清掃過後，黑菱江水浮著半死的人們象筏子似的滾滾流去，殘留在江岸大片血泊中的只是些散亂丟棄鞋、帽和包袱之類。就是連這些遺物，也都被蹂躪得一無完形。」

璦琿副都統衙門筆帖式楊繼功曾經記述：「二十一日(公歷七月十七日)午前十一鍾時，遙望彼岸，羅剎驅無數華僑圈圍江邊，喧聲震野。細瞥羅剎兵各持刀斧，東砍西劈，斷屍粉骨，音震酸鼻，傷重者斃岸，傷輕者死江，未受傷者皆投水溺亡，骸骨漂溢，蔽滿江洋。」

目睹這場大屠殺的人，無不感到『毛骨悚然和為之心碎』。就連屠殺者也受到了良心的譴責，一個羅剎國義勇兵說：「殺人的一方，完全滅絕人性，他們不是魔鬼，便是畜性。在人世間竟能看到如此慘景，……簡直就是一場惡夢。如果被殺的人都是些還有掙扎能力的男子的話，也許不會如此凄慘，但是當看到一些緊摟嬰兒企圖逃脫的母親被紛紛刺倒，從懷中滾落的嬰兒被碾得粉碎時，只有那些完全沒有人性的野獸才能禁得住。」

海蘭泡大屠殺從1900年7月16日一直進行到21日，共奪去了五千多名華蘭人的生命，只有少數人游到對岸得以逃生。1900年7月22日，阿穆爾當局宣布，海蘭泡華蘭人被全部『肅清』了。事發十幾天後，沉溺在黑菱江底的無數死難者屍體浮上水面順流淌去，江面漂浮油層，江水為之奇腥。

1900年7月17日，阿穆爾當局舉行海蘭泡大屠殺的同時，另派出軍隊撲向江東六十四屯，對華蘭居民舉行了多次掃盪。羅剎兵『驅各屯居民聚於一大屋中』舉火焚燒，大部分人都被活活燒死。

羅剎兵又『沿村發火』，毀盡房屋，槍殺居民，僅博爾多屯一地就殺害了上千人。最後羅剎軍將『未及過江者，不分男婦老幼，農夫工匠，負販商賈及民間各行等業一同逼入江中，通共浮水得生者不過六七十人，其余均被逼溺死江中，浮屍蔽江者數日不絕。』至21日，羅剎軍將華蘭居民的村庄全部搗毀干凈，這次江東六十四屯慘案，又奪去了二千余名華蘭居民的生命。