為了達到全殲的目的，艦載機們舍棄了龐大的日向號戰列艦，轉而先解決那些驅逐艦和巡洋艦。利用有限的彈葯，艦載機飛行員們幾乎是貼到近前才發動攻擊，因此准確性極高，幾乎所有的魚雷和炸彈都找到了自己的目標。

巡洋艦和驅逐艦被一掃而空，等到飛機彈盡離開，海面上只剩下了孤零零的日向號戰列艦。這樣艱難的情況，已經沒有了挽回的可能，山本五十六不禁仰天長嘆，真是時不我待啊。

日向號最後的結局並未等待多久，殘破的艦身緩慢前行了半個小時之後，碰上了迎面而來的潛艇大隊。這支潛艇部隊隸屬於光海城總基地，在發現倭軍聯合艦隊之後，各支艦隊都抽調力量進行圍剿，光海城為了保住城市，不被對方所攻擊，潛艇部隊也出擊了。

這支有潛艇部隊司令官陳濤少將親自率領的，擁有十二艘海狼3型潛艇的龐大編隊，也受到了偵察機報告。利用先進的電子導航儀，潛艇部隊得以精確的找到了對方的位置，當他們接近夷州海峽入口的時候，已經隱隱看到了行駛而來的巨大黑影。雖然已是日近黃昏，陳濤還是從哪巨大的身形與倭國特有的塔式桅桿上，辨認出了對方的身份。

見到對方只是孤零零的一艘軍艦，陳濤立刻興奮了起來。他命令周圍的十二艘潛艇靠攏過來，圍剿這艘龐大的戰列艦。排水量高達三萬多噸的日向號戰列艦，本應該擁有近24節的速度，但是因為動力裝置受損，它只能以十二節的速度航行。

這樣的速度給了潛艇充足的攻擊機會，因為他們浮出水面的時候，速度能夠達到17節。向前航行的倭國水兵們頗有劫後余生的感覺，他們並不知道海面之下還有著巨大威脅。

陳濤下達了進攻的命令，他所親自指揮的3001號潛艇首先發射出兩枚魚雷。威力巨大的魚雷以筆直的航跡，朝著日向號撞去，而已經從緊張戰斗中松懈下來的倭國水兵們，還沒有發現危險已經迫近。

轟的一聲巨響，讓倭國水兵們幾乎立腳不穩，在戰艦的左舷暴起大團的水霧，隨後就是猛烈的火焰從艙門出躥了出來。

「有敵襲。」倭兵們凄厲的慘叫聲此起彼伏，他們喊叫著沖向自己的戰位，但為時已晚。爆炸聲就是最好的開火命令，隨著一艘艘潛艇開始釋放魚雷，道道航跡向著日向號延伸。

這艘龐大的戰列艦尚未作出什么規避動作，十四枚魚雷就擊中了他的艦身。劇烈大爆炸聲讓戰列艦多處解體，隨處可見的大洞讓損管人員無所適從。無奈之下，山本五十六少將只好命令棄艦，倭國聯合艦隊碩果僅存的一艘戰艦也被放棄了。