天風衛生局發布緊急告示，列出喝開水、吃熟食、注意生活衛生等10條預防措施。帝都則令各街巷剃頭棚房屋一律裱糊干凈，地下均墊石灰，所有鋪內伙友，衣服、搭布、手帕每日更新三次。如發現私自通行於斷絕交通之處及隨地便溺不遵守公共衛生者，處以五元至三十元不等的罰款。

盡管防疫工作做得如此到位，即使是後世的眼光來看也很科學，但鼠疫卻沒有得到有效控制。伍連德開始深思，流行在冥北的這種致人死命的惡疾到底是不是鼠疫。

作為一名嚴謹的科學工作者，伍連德決定還是通過化驗來判斷。就在伍連德入住傅家甸之後的一個半月，一名與當地人通婚的倭國女人疫死，伍連德當即決定解剖屍體，找出真正的病因。

在孫姚兩位醫生的帶領下，伍連德和助手來到一間幽暗骯臟的小屋，倭國女人就穿著一件簡陋的和服躺在榻榻米上。經過簡單的消毒和防護措施，解剖開始了，伍連德用刀片劃開了死者的胸膛取出肋骨，用注射器抽出死者心臟、肺臟和脾臟的血液，並把它們放在載玻片上以備回去化驗。隨後他們將屍體小心地縫好穿上衣服，安放在政府提供的棺材中。解剖的全過程嚴格保密，甚至連死者的家人也不知道發生了什么。

這大概是冥北乃至全華蘭境內第一次屍體解剖了，在華蘭人的觀念中，解剖屍體無疑是對死者的大不敬，一旦被當地百姓知道，必將引起人們的恐慌和憤怒。何況如今的後金律之中也不允許解剖，可見伍連德此時承受了多大的壓力。

事實證明，這個險冒的相當值得。經過化驗，伍連德在死者的血樣中發現了鼠疫桿菌，由此可以確定流行在傅家甸的惡疾正是鼠疫。但這種疾病是通過飛沫傳播的，與鼠疫公認的傳播方式相矛盾，這又怎么解釋呢？這時伍連德大膽地提出，在傅家甸流行的鼠疫不同以往，它是可以通過飛沫傳播的肺鼠疫。也就是說無需通過老鼠，肺鼠疫就可以在人與人之間傳播。

找到了病因，伍連德立刻決定啟程回哈爾濱，他要盡快召集人手，展開對鼠疫的防治工作，但一開始他的理論就沒有被同行接受。就在伍連德到達哈爾濱之前，倭國南金鐵路已派一名日本醫生前來調查病因，而這名倭國醫生正好受教於鼠疫桿菌的發現者——著名學者北里柴三郎。

對於老師的理論，倭國醫生是深信不疑的。他剛剛抵達哈爾濱就立即雇人捉四處老鼠，以期在老鼠身上發現鼠疫桿菌。可是一連解剖了幾百只老鼠，他始終沒有在老鼠身上發現預料中的鼠疫桿菌。